联合分析不是要把两个庞大数据表硬拼成一张更大表，而是在统一生物学假设下，让转录变化与代谢末端表型互为证据：前者提示调控候选，后者刻画功能执行层面的化学读出。理想情况下两组学来自层级对应的样本——同一时间点、同一处理梯度、可追溯的个体差异——再配合严格的批次记录，才能在相关网络里讨论调控方向而不是批次噪音。

核心逻辑一览

图 1. 先在各自组学筛选特征，再在公共通路库中寻找统计汇聚，比单纯点对点相关更抗压噪。

统计学与实验设计常见问题

是否必须一一配对？ 队列研究可用区块设计 + 混杂校正；干预研究尽量配对或可重复时点。如何把基因与代谢物挂钩？ 常见策略包括：KEGG/Reactome map层级注释、相关性网络（sparCC/WGCNA一类思路）、以及与先验文库（脂质、次级代谢簇）耦合。只看到转录变而代谢没变？ 可能涉及翻译后调控、降解、区室化或未覆盖的代谢色谱维度——需在讨论里显式写明局限。

图 2. 记录取样顺序、试剂批号、测序 lane 与质谱序列，比在事后补丁式消除批次更省事。

应用场景速览

1、药物/胁迫响应：抓取早期转录重编程与中后期代谢 footprints。

2、微生物组相关课题：可把 16S/宏基因组信息作为第三条轴（站内另有整合条目）。

3、脂质 / PTM：若故事聚焦膜脂或磷酸化通路，可看脂质组、修饰蛋白组‑代谢组联合页。

图 3. 宿主‑微生物、宿主‑脂质等题目常需要三角证据，预先定义主响应变量可避免分析发散。

FAQ

1、联合分析一定要用同一管样本分两路提取吗？

并非总是可行，但需要证明子样本之间存在可比的分流方案。

2、阈值怎么设？

RNA 与代谢物各自平台差异大，多采用分平台 false discovery 策略再取交集。

3、能写因果结论吗？

组学相关性支持假设，往往需要扰动实验或动力学验证。

结论

高质量的转录‑代谢联合不在于堆叠测序深度或质谱张数，而在于可追溯的取样与批次透明度以及在通路层如何把调控候选和末端化学证据对齐。明确科学问题与时间轴后，再选择相应的整合产品与验证实验，可把多组学从heatmap 装饰拉回可检验的生物学叙事。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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