标记质谱与蛋白质定量:体内/体外同位素标记与 Label-free 如何选
产品名称: 标记质谱与蛋白质定量:体内/体外同位素标记与 Label-free 如何选
英文名称: Isotope Labeling and Label-free Quantification for Proteomics: Selection of In Vivo and In Vitro Labeling Methods
产品编号: labeled-mass-spectrometry-guide
产品价格: 询价
产品产地: 中国北京
品牌商标: 百泰派克生物科技
更新时间: 2026-07-13T11:03:38
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标记质谱定量并不是单独仪器模式,而是样品层面先引入可被质谱读出的质量或信号差异编码,再把混合样品一次进机,用 MS1 质量差、MS2 reporter 或色谱峰面积提取实现各通道相对丰度。代谢标记(体内)典型为细胞培养时掺入稳定同位素氨基酸(SILAC);提取后体外标记则包括 iTRAQ/TMT 等同重标签,或 ^18O 酶切水、化学二甲基化二甲基等。非标记 Label-free则不加重量编码,靠多次上机与色谱对齐做峰面积或谱计数比较。
关键对比
| 类型 | 示例 | 样品要求 | 读出方式 |
|---|---|---|---|
| 代谢 | SILAC | 活细胞传代 | MS1 配对质量 |
| 肽段同重 | iTRAQ/TMT | 消化后标记 | MS2 reporter |
| 化学小分子 | Dimethyl | Lys/端胺 | MS1 移位 |
| 非标记 | LF | 高通量多样本 | 对齐 + 面积统计 |

图 1. 体内更早引入同位素稀释到蛋白合成;体外在酶切后才统一标签化学。

图 2. 预处理与归一直接影响标记策略输出可比性。
FAQ
为什么有时仍偏好 Label-free? 超大样本梯队或无法用统一标记化学时,LF/DIA动态范围方案更灵活。标记失败信号? 检查 pH、反应时间、盐残留与样品氧化。SILAC可否用于临床组织? 代谢标记主要面向培养体系;实体组织可走体外化学或 LF。

图 3. 快速定位:先试能否统一酶切,再看活体标记可行否。
延伸:绝对定量
若需摩尔级绝对量常在靶向 PRM/MRM + 稳定同位素合成肽曲线或 AQUA 段落实现,与发现型 shotgun 定量目标不同——请按科学问题分拆项目。
结论
标记质谱通过化学或代谢方式把哪份样品信息编码入质量维度或次级谱信号,从而获得更有纪律性的相对比较;但并非所有课题都必须标记——近年来 SWATH/DIA + 严格队列设计常与 iTRAQ/TMT/SILAC 并列备选。最终选型应回归到:活体可行性、并联通道数、统计功效、色谱重复稳定性与是否需要绝对定量。将需求交代清楚可由专业团队在数据库、仪器碎裂和数据归一链路层定制组合。
百泰派克生物科技特色项目
一、蛋白测序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析,提供基于质谱的蛋白测序分析服务,包括对蛋白质的氨基酸组成分析,N端测序,C端测序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质,提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务,对蛋白序列进行分析。
※服务优势:
1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;
3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;
4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;
5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug,即可完成检测;
6.测序不受N端封闭,PEC和和糖基化等N端修饰的影响。
二、蛋白质组学
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务,助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。
※服务优势:
1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析,发现新的生物标记物;
2.体内体外多种蛋白质标记方法,适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;
3.质谱分析灵敏度高,实验结果重复度高;
4.可检测较低丰度蛋白,线性范围广;
5.专业生物信息学分析,分析更系统准确。
三、单细胞质谱流式技术分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析,采用金属元素标记物(通常是金属元素标记的特异抗体)标记细胞表面和内部的分子,然后用流式细胞原理分离单个细胞,再用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)分析单个细胞的原子质量谱,最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。
※服务优势:
1.技术先进,填补技术空白
采用金属标记抗体技术,避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征,百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。
2.分析数量大,成本较低
单细胞RNAseq受成本等因素限制,所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右,而流式质谱技术一次(单样本)就可分析至少10^5的细胞,实现了数量级的提高,且成本不高于单细胞RNAseq。
3.应用前景大
①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化,在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景;
②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外,质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰;
③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现
百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析,可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究,旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案,深入挖掘未知的靶标。
五、生物药物表征
百泰派克基于高分辨率质谱技术,MALDI TOF,高效色谱分离技术,提供一系列完善的生物药物分析方案,从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析,到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务,帮助生物医药生产商提高生物药物品质。
百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则,通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证,建立了完备的质量体系,数据冷热/异地备份,设备定期计量/期间核查,软件审计追踪,为客户提供一体化解决方案和技术服务,支持新药研发、药物申报注册和生产放行。
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